少年派2经过几个世纪无休止的战争，宇宙终于进入了和平时期，两百多个主权星球联合起来成立了以圣托斯星为中心的庞大的星际联盟。由于各星球之间的距离以数千光年计，星际运输因此变得非常重要。强大的菲伦财团几乎垄断了星际运输并使其霸权触及到各个合法或非法的领域。为了最大限度地获得利润，它用尽了一切手段。以马洛为代表的太空勇士们，和其他拒绝向财团屈服的正直人士，顽强的与财团做抗争。他们技艺高超，乐于助人，是一些有叛逆精神的优秀的飞行员。为了正义，他们一次次挫败了财团的阴谋。