下水道里的美人鱼电影本剧以讲述了自报志愿被分配到朴素且无人问津的警视厅身份不明者咨询室的怪人三田樱，和比她大10岁的同期生月本真，两人性格和兴趣完全相反。明朗天真烂漫的樱，冷静沉着的真，虽然一见面就互相埋怨，但无论如何都想让更多的身份不明者回到家人身边，凭借遗体上留下的一点点线索解开谜团的人性推理故事。